Pour la conservation de certaines espèces, il est primordial que les agriculteurs gèrent les prairies de manière à préserver leur diversité. Par exemple, le Râle des genêts, oiseau emblématique des prairies de la Voire est très sensible aux fauches précoces qui détruisent les jeunes non volants à cette période. La présence de haies ou d'éléments boisés dans les prairies est très importante pour certaines espèces comme la Pie grièche écorcheur qui recherche des buissons épineux pour construire son nid et se pose sur des points hauts (branches, piquets) pour repérer ses proies.

Pour adapter les pratiques agricoles aux enjeux écologiques des sites, les exploitants agricoles ont possibilité de s'engager dans des mesures agro-environnementales qui ont pour objectifs de :

- maintenir les prairies de fauche et inciter à gérer les parcelles par la fauche tardive,

- favoriser des pratiques agricoles respectueuses de la biodiversité sur les prairies, notamment par la gestion extensive des prairies pâturées en limitant le chargement et la fertilisation,

- favoriser la remise en herbe de terres arables et le maintien des jachères existantes.

Des aides financières sont apportées en contrepartie de ces engagements.